9月7日，云贵交界处发生地震后，云南省省委、省政府当晚召开灾情现场会议，要求确保搜救不留死角和盲点，尽最大努力抢救伤员生命，全力以赴安排好受灾群众基本生活，防范余震破坏和次生灾害。目前，除彝良县医疗卫生人员外，来自卫生部、省、军队、武警的35支医疗卫生防疫队共699人，在灾区开展医疗救治及卫生应急工作。其中，医疗救治队30支共473人，卫生防疫队5支共226人。
9月8日上午，云南省卫生厅召开省级医院及昆明市卫生局相关负责人会议，要求省、市各医疗机构进入应急状态，按照卫生部部长陈竺提出的“集中专家、集中伤员、集中时间、集中救治，尽最大努力、最大力量降低死亡率、减少致残率”的救治要求，千方百计确保转运伤员得到及时有效的救治。
9月8日，根据卫生应急队伍人员情况，该省调整了治疗管理计划：彝良县医院3个病区分别由宜宾市医疗队、华西医学院医疗队和昭通市一院医疗队负责治疗管理，县医院人员负责协助和后勤保障；筠连县医院医疗队协助彝良县中医院；武警总队医疗队随救灾队伍开展急救工作；43医院设置治疗点，开展病人治疗工作。同时，整合各专业专家对重症病人进行会诊，提出治疗转诊意见。
据初步统计，彝良县有7家卫生院、75个村卫生室房屋受损，昭阳区有12054平方米、大关县有17908平方米、镇雄县有5498平方米、永善县7030平方米卫生单位房屋受损。
